La durée se met après le verbe
等了你一个小时 : le temps passé à faire quelque chose se place derrière le verbe, jamais devant. Quand le verbe a déjà un complément, comme ici 你, la durée vient après lui ; on entend aussi la solution qui répète le verbe, 等你等了一个小时. Le français place la durée où il veut, le chinois non.